Східний апеляційний господарський суд очолює голова суду, який відповідно ст. 29 Закону України «Про судоустрій і статус суддів»:

- представляє суд як орган державної влади у зносинах з іншими органами державної влади, органами місцевого самоврядування, фізичними та юридичними особами;

- визначає адміністративні повноваження заступників голови апеляційного суду;

- контролює ефективність діяльності апарату суду, погоджує призначення на посади керівника апарату суду, заступника керівника апарату суду, вносить подання про застосування до керівника апарату суду, його заступника заохочення або накладення дисциплінарного стягнення відповідно до законодавства;

- видає на підставі акта про призначення судді на посаду, переведення судді, звільнення судді з посади, а також у зв’язку з припиненням повноважень судді відповідний наказ;

- повідомляє Вищу кваліфікаційну комісію суддів України та Державну судову адміністрацію України, а також через веб-портал судової влади про вакантні посади суддів в апеляційному суді у триденний строк з дня їх утворення;

- забезпечує виконання рішень зборів суддів апеляційного суду;

- організовує ведення та аналіз судової статистики, організовує вивчення та узагальнення судової практики, інформаційно-аналітичне забезпечення суддів з метою підвищення якості судочинства;

- сприяє виконанню вимог щодо підтримання кваліфікації суддів апеляційного суду та підвищення їхнього професійного рівня;

- здійснює інші повноваження, визначені законом.

   Голова апеляційного суду з питань, що належать до його адміністративних повноважень, видає накази і розпорядження.

   У разі відсутності голови Східного апеляційного господарського суду його адміністративні повноваження здійснює заступник голови суду.

   Відповідно до ст. 30 Закону України «Про судоустрій і статус суддів» заступник голови апеляційного суду здійснює адміністративні повноваження, визначені головою суду.